Im 17. Jahrhundert überquerte eine japanische Delegation zum ersten Mal den Pazifik, um Beziehungen mit Europa aufzunehmen. Sie segelte auf einem 55 m langen und 50 m hohen, für Hochseefahrten gebauten Holzschiff, der "Sant Juan Bautista". Dieses Schiff wurde jetzt nachgebaut und ist neben einer Dokumentation der großen Errungenschaften jener japanischen Pioniere, das zentrale Exponat der Museumsanlage.